PDB файлдарын ашу, өңдеу және түрлендіру
PDB файл кеңейтімі бар файл , ең алдымен, бағдарлама немесе модуль туралы ақпаратты DLL немесе EXE файлы сияқты отладки туралы ақпаратты сақтау үшін пайдаланылатын бағдарлама дерекқорының форматында жасалған файл. Олар кейде таңбалық файлдар деп аталады.
PDB файлдары түпнұсқалық кодтағы әртүрлі компоненттер мен мәлімдемелерді соңғы түпкілікті шығарылған өнімге салыстырады, бұл ретте түзету құралы бастапқы файлды табу үшін және ол отладтау процесін тоқтату керек орындалатын орында орналасқан жерді табу үшін пайдалана алады.
Кейбір PDB файлдары Protein Data Bank файл пішімінде болуы мүмкін. Бұл PDB файлдары - бұл ақуыз құрылымдарына қатысты координаттарды сақтайтын қарапайым мәтіндік файлдар.
Басқа PDB файлдары Palm Database немесе PalmDOC файл пішімінде жасалған және PalmOS мобильді операциялық жүйесімен бірге қолданылған болуы мүмкін. Бұл пішімдегі кейбір файлдар орнына .PRC файл кеңейтімін пайдаланады.
PDB файлын ашу әдісі
Әр түрлі бағдарламалар өздерінің PDB файлдарын құрылымдық дерекқор пішімінде деректерді сақтау үшін пайдаланады, сондықтан әрбір бағдарлама PDB файлының өзіндік түрін ашу үшін қолданылады. Geneious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio және Pegasus - бұл PDB файлын дерекқор файлы ретінде қолдануға болатын бірнеше бағдарлама. PDA файлдарын ашу үшін Radare және PDBparse мүмкін.
Кейбір PDB файлдары Geneious 'Program Debug Database файлдары секілді кәдімгі мәтін ретінде сақталады және мәтін редакторында ашылған болса, адамға оқуға болады. Сіз PDB файлының осы түрін Windows жүйесіндегі кірістірілген Notepad бағдарламасы сияқты мәтіндік құжаттарды оқуға болатын кез келген бағдарламамен ашуға болады. Кейбір басқа PDB файл көрермендері мен редакторлары Notepad ++ және жақшаларды қамтиды.
Басқа PDB дерекқор файлдары мәтіндік құжаттар емес және олар үшін арналған бағдарламамен ашылғанда ғана пайдалы. Мысалы, егер сіздің PDB файлыңыз «Quicken» -ге байланысты болса, PDB файлын қарау немесе өңдеу үшін сол бағдарламалық жасақтаманы пайдаланып көріңіз. Visual Studio PDB файлын DLL немесе EXE файлымен бірдей қалтада көруді күтеді.
Сіз Protein Data Bank файлдары, PDA файлдарын, Windows, Linux, MacOS және Avogadro файлдарын көре және редакциялай аласыз. Jmol, RasMol, QuickPDB және USCF Chimera де PDB файлын аша алады. Бұл файлдар қарапайым мәтін болғандықтан, PDB файлын мәтін өңдегішінде де ашуға болады.
Palm Desktop Palm Database файл пішімінде болатын PDB файлдарын аша білуі керек, бірақ оны алдымен осы бағдарлама үшін .PRC файл кеңейтімін алу үшін оны қайта атауыңыз қажет болуы мүмкін. PalmDOC PDB файлын ашу үшін STDU Viewer қолданыңыз.
PDB файлын қалай түрлендіруге болады
Бағдарлама дерекқорының файлдары, ең болмағанда, тұрақты файл конвертерінің құралымен емес, басқа файл пішіміне түрленбеуі мүмкін . Оның орнына, PDB файлының түрін түрлендіретін кез-келген құрал болса, оны ашуға болатын бағдарлама болар еді.
Мысалы, PDB дерекқорының Quicken файлын түрлендіру қажет болса, сол бағдарламаны пайдалану үшін пайдаланып көріңіз. Бұл түрлендіру түрі, ең алдымен, кішкене пайдалану ғана емес, сонымен қатар осы деректер базасының қосымшаларында қолдамауы мүмкін (мысалы, PDB файлының осы түрін басқа форматқа түрлендірудің қажеті жоқ).
Protein Data Bank файлдары MeshLab көмегімен басқа форматтарға түрлендірілуі мүмкін. Бұл әрекетті орындау үшін алдымен PDM файлын WRL файлымен PyMOL-пен File> Save As As> VRML мәзірінен түрлендіріп, содан кейін MeshLab-ге WRL файлын импорттаңыз және PDB-ні түпкілікті түрде түрлендіру үшін File> Export Mesh As файлды STL немесе басқа файл пішімі.
Егер сізге түс үлгісі қажет болмаса, PDB файлын USCF Chimera арқылы STL-ге тікелей экспорттай аласыз (жүктеу сілтемесі жоғары). Әйтпесе, PDB-ді USCF Chimera-мен WLL-ге айналдыру үшін MeshLab-мен бірге жоғарыдағыдай әдісті қолдануға болады, содан кейін WRL файлын STL-ге MeshLab-пен экспорттауыңызға болады.
PDB-ні PDF немесе EPUB- қа айналдыру үшін PalmDOC файлы бар болса, Замзар секілді онлайн-PDB түрлендіргішті қолдануға болады . Сіз PDB файлын сол веб-сайтқа жүктеп, сол пішімдерге, сондай-ақ AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT және басқа электрондық кітап файл пішімдеріне түрлендіру мүмкіндігіне ие бола аласыз.
PDB файлын FASTA пішіміне түрлендіру үшін Meiler Lab онлайн-PDB-мен FASTA түрлендіргішіне қосылуға болады.
Сондай-ақ PDB-ді PDBx / mmCIF арқылы онлайн режимінде CIF (Crystallographic Information format) түрлендіруге болады.
PDB файлдарында қосымша оқу
Microsoft, GitHub және Wintellect бағдарламаларының бағдарламалық дерекқорлары туралы көбірек біле аласыз.
Сондай-ақ, Protein Data Bank файлдары туралы қосымша ақпарат бар; Дүниежүзілік протеиннің деректер банкін және RCSB PDB бөлімін қараңыз.
Файлыңыз әлі ашылмайды ма?
PDB файлдары, жоғарыда көрсетілген құралдардың бірімен ашылмаған, шынымен PDB файлдары болып табылмайды. Не болып жатқаны - файл кеңейтімін дұрыс емес түрде оқып жатырсыз; кейбір файл пішімдері «.ПДБ» дегенмен өте тығыз ұқсас суффиксті пайдаланады, олар шынымен байланыссыз және бірдей жұмыс істемейді.
Мысалы, PDF файлы құжаттың файлы болып табылады, бірақ жоғарыдағы бағдарламалардың көпшілігі осы бағдарламалық жасақтамалармен біреуін ашуға тырыссаңыз, мәтінді және / немесе суреттерді дұрыс көрсетпейді. PD, PDE, PDC және PDO файлдары сияқты ұқсас кеңейтілген файлдармен басқа файлдар үшін де дәл осылай болады.
PBD - бұл EaseUS Todo Backup бағдарламасына кіретін және сол себепті сол бағдарламалық жасақтама арқылы ашылғанда ғана пайдалы.
Егер сізде PDB файлы жоқ болса, файлды ашатын немесе түрлендіретін тиісті бағдарламаны табуға болатын файл кеңейтімін зерттеңіз.